Vinculado à Secretaria de Estado do Meio Ambiente do Amapá – SEMA, com a finalidade de opinar sobre questões técnicas, científicas, jurídicas e metodológicas, relativas ao SECISA, respaldando com subsídios o COEMA, na realização de suas atribuições. Este Comitê será composto por no mínimo cinco personalidades de reconhecido mérito e conhecimento na área, convidadas pela SEMA, sendo pelo menos dois Integrantes da Rede Integrada de Pesquisa do Estado do Amapá – RIPAP; e três pesquisadores/experts de reconhecido mérito.